甜瓜蔓枯病由子囊菌亚门瓜类球腔菌侵染所致。病菌以分生孢子器及子囊壳在病株残体上越冬、越夏。第二年春暖时，产生分生孢子及子囊孢子，借风雨传播，成为田间初侵染。以后病部产生的分生孢子继续传播蔓延，引起再侵染。病菌多从整枝、摘心的伤口及其他伤口处侵入，浸入组织以后潜育期为7-10天，种子表面也可带菌子，种子发芽后病菌直接危害子叶。
品种间抗病性差异明显，一般薄皮脆瓜类属抗病体系，发病率低，耐病力强；厚皮甜瓜较感病，尤其是厚皮网纹系统、哈密瓜类明显感病。高温高湿、种植过密、通风不好、缺肥或偏施氮肥、植株生长弱有利发病。浇水过多、放风不及时、连作重茬地易发病
叶霉病菌除了附着在温室、大棚、小拱棚等的玻璃、塑料薄膜、支架、支柱等表面生存之外，也残留在病叶上形成源。此外，亦可经种子。 病斑上生成的分生孢子被风吹至叶片 上，萌发出芽管后其菌丝从气孔处侵入，约2周后发病，在叶背面生成众多的分生孢子。这些分生孢子被风吹散，逐渐蔓延。叶霉病菌喜好20—25℃的温度和95%以上的湿度。
换气不充分的早春、晚秋及冬季的温室和大棚栽培的番茄都可以发病。密植及过多易发病，生长衰竭，尤其是收获期脱肥时，发病率很高。作为预防对策，要栽培抗性品种，注意换气，避免过度和密植。
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